239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03404 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  81.97 
 
 		 245 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  75.21 
 
 		 246 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.31 
 
 		 243 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.9 
 
 		 243 aa  362  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.97 
 
 		 243 aa  359  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.49 
 
 		 243 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  72.73 
 
 		 243 aa  353  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  72.73 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  72.73 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.73 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.73 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  72.73 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.73 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.73 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.31 
 
 		 243 aa  351  8e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.49 
 
 		 243 aa  348  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.9 
 
 		 243 aa  347  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.49 
 
 		 243 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.49 
 
 		 243 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.49 
 
 		 243 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.49 
 
 		 243 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.07 
 
 		 243 aa  344  8.999999999999999e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  70.66 
 
 		 243 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.01 
 
 		 243 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.07 
 
 		 243 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.07 
 
 		 243 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.07 
 
 		 243 aa  340  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.07 
 
 		 243 aa  340  9e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.31 
 
 		 243 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.03 
 
 		 244 aa  335  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.02 
 
 		 265 aa  332  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.13 
 
 		 245 aa  332  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3023  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.13 
 
 		 245 aa  327  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.316333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.13 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.72 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.31 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.72 
 
 		 245 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2845  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.72 
 
 		 245 aa  325  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2927  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.72 
 
 		 245 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3109  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.72 
 
 		 245 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00124308  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.31 
 
 		 245 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1162  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.72 
 
 		 245 aa  325  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.31 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.72 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  67.08 
 
 		 250 aa  322  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.31 
 
 		 245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1151  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.72 
 
 		 245 aa  316  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.6 
 
 		 241 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.6 
 
 		 241 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.8 
 
 		 270 aa  309  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.46 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.61 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.34 
 
 		 246 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.4 
 
 		 248 aa  301  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.69 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.69 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.32 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.1 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.45 
 
 		 265 aa  295  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.55 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.27 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.79 
 
 		 260 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.66 
 
 		 247 aa  294  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.22 
 
 		 244 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.55 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.34 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.57 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.34 
 
 		 246 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.92 
 
 		 246 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.5 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2083  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.9 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.301818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  59.92 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.08 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.94 
 
 		 251 aa  287  9e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.42 
 
 		 246 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.9 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.25 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.98 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0031  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.37 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.57 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.31 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.66 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.66 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1013  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4249  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.66 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.92 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.07 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1137  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.07 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1500  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  62.66 
 
 		 241 aa  275  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1066  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61 
 
 		 263 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0840275  normal  0.0462592 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2167  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.66 
 
 		 258 aa  274  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761233  normal  0.284873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>