239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1667 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.71 
 
 
243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  65.4 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  63.71 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  63.71 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.71 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.71 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  63.71 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.71 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.71 
 
 
243 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.29 
 
 
243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.87 
 
 
243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  64.14 
 
 
243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.49 
 
 
245 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
243 aa  301  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
243 aa  301  9e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.87 
 
 
243 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  63.6 
 
 
250 aa  300  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.18 
 
 
243 aa  300  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.87 
 
 
243 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.87 
 
 
243 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.87 
 
 
243 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.26 
 
 
265 aa  298  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
243 aa  297  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.76 
 
 
243 aa  297  9e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.6 
 
 
241 aa  295  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.6 
 
 
241 aa  295  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.22 
 
 
246 aa  295  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
243 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
243 aa  295  6e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.45 
 
 
243 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.66 
 
 
250 aa  294  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.03 
 
 
246 aa  293  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  65.38 
 
 
270 aa  292  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61 
 
 
243 aa  292  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.25 
 
 
243 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.34 
 
 
243 aa  290  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0031  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.81 
 
 
244 aa  289  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.18 
 
 
248 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.32 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.48 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.92 
 
 
243 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  56.28 
 
 
255 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.7 
 
 
240 aa  275  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.7 
 
 
240 aa  275  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.22 
 
 
246 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533412  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.05 
 
 
251 aa  274  8e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.32 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59 
 
 
254 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
245 aa  270  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.51 
 
 
254 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61 
 
 
245 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.24 
 
 
245 aa  269  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.33 
 
 
248 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.17 
 
 
248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.61 
 
 
247 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.09 
 
 
260 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.35 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.56 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.68 
 
 
254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.59 
 
 
244 aa  265  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.78 
 
 
257 aa  264  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2083  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.41 
 
 
246 aa  264  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.301818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61 
 
 
265 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61 
 
 
245 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.18 
 
 
257 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1351  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
245 aa  263  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.18 
 
 
257 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.56 
 
 
248 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.18 
 
 
257 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.18 
 
 
257 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.18 
 
 
257 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.18 
 
 
257 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.58 
 
 
240 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  58.51 
 
 
246 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.18 
 
 
257 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.09 
 
 
246 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.57 
 
 
246 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1162  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.17 
 
 
245 aa  261  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.5 
 
 
242 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.5 
 
 
242 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.5 
 
 
242 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.79 
 
 
235 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.79 
 
 
235 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3109  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.17 
 
 
245 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00124308  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.66 
 
 
246 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.5 
 
 
264 aa  260  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.95 
 
 
248 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.41 
 
 
239 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.75 
 
 
245 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.5 
 
 
248 aa  260  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.66 
 
 
240 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.23 
 
 
246 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.81 
 
 
249 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.75 
 
 
245 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.58 
 
 
245 aa  259  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
264 aa  259  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.25 
 
 
242 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.34 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>