239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1733 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.88 
 
 
236 aa  359  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.73 
 
 
236 aa  351  8e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.61 
 
 
235 aa  347  8e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1690  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.49 
 
 
236 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.368912  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.06 
 
 
235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.34 
 
 
238 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
247 aa  259  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.65 
 
 
243 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  53.65 
 
 
243 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  53.65 
 
 
243 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  53.65 
 
 
243 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.65 
 
 
243 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.65 
 
 
243 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.65 
 
 
243 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.65 
 
 
243 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.59 
 
 
243 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.22 
 
 
243 aa  247  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.16 
 
 
243 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.36 
 
 
245 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.59 
 
 
243 aa  241  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.06 
 
 
242 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.06 
 
 
242 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.06 
 
 
242 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.64 
 
 
243 aa  241  1e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.27 
 
 
239 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.18 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  50 
 
 
243 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.43 
 
 
243 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.17 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.5 
 
 
243 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.5 
 
 
243 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.5 
 
 
243 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.5 
 
 
243 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.5 
 
 
243 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.28 
 
 
242 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.33 
 
 
254 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
243 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1804  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.91 
 
 
239 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207619  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.63 
 
 
243 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
254 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.49 
 
 
251 aa  235  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2257  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.49 
 
 
239 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.93 
 
 
244 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.07 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.49 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2166  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.56 
 
 
238 aa  234  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.32 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.48 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.48 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  49.57 
 
 
243 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
248 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.05 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
240 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.5 
 
 
243 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0642  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.5 
 
 
245 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.1 
 
 
235 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.1 
 
 
235 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.05 
 
 
243 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.52 
 
 
243 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.78 
 
 
249 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1885  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 
239 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000732794  hitchhiker  0.00000000475833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.07 
 
 
236 aa  229  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.834092  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.64 
 
 
238 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14741  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.07 
 
 
245 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  0.931321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 
250 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.64 
 
 
255 aa  228  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0196  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.97 
 
 
254 aa  228  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2563  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.17 
 
 
252 aa  228  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117328  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0422  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.28 
 
 
244 aa  228  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.644654  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2729  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
239 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.27 
 
 
248 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 
245 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11981  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.64 
 
 
238 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.526754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
249 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.47 
 
 
323 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.64 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.9 
 
 
246 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
240 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
240 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1256  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.36 
 
 
241 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.29 
 
 
240 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0516  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.15 
 
 
248 aa  223  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.48 
 
 
246 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.533412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0184  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.54 
 
 
248 aa  222  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  50.85 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.86 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1414  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.44 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2043  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.5 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.5 
 
 
235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1600  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.89 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.06 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.86 
 
 
248 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  47.5 
 
 
255 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.28 
 
 
243 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2309  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.95 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0100361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 
270 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
239 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>