239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0595 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  77.24 
 
 
259 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  76.83 
 
 
259 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71 
 
 
265 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.4 
 
 
257 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.05 
 
 
262 aa  345  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.48 
 
 
252 aa  344  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.4 
 
 
258 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.29 
 
 
254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.26 
 
 
271 aa  318  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.93 
 
 
276 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  59.27 
 
 
255 aa  289  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.23 
 
 
241 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.06 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.21 
 
 
251 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.96 
 
 
260 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.96 
 
 
260 aa  221  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.82 
 
 
255 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  47.41 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.49 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.97 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.38 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.97 
 
 
239 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.94 
 
 
240 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  44.49 
 
 
237 aa  203  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.58 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.98 
 
 
250 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.74 
 
 
248 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.24 
 
 
250 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.38 
 
 
250 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.33 
 
 
245 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.04 
 
 
238 aa  194  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.5 
 
 
246 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.31 
 
 
250 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.08 
 
 
246 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.04 
 
 
244 aa  180  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.68 
 
 
244 aa  155  9e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40 
 
 
241 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
270 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.86 
 
 
254 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 
249 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.95 
 
 
248 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.32 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.18 
 
 
254 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.08 
 
 
258 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.46 
 
 
254 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1137  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4249  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
258 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  33.47 
 
 
250 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.24 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 
248 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.75 
 
 
246 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.08 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1013  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.08 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2167  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.24 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761233  normal  0.284873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36 
 
 
245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2043  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.74 
 
 
241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.32 
 
 
246 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.87 
 
 
243 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.87 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.32 
 
 
246 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 
246 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1256  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.86 
 
 
241 aa  131  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.51 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.8 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.69 
 
 
240 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.69 
 
 
240 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 
241 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.39 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 
241 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
243 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.43 
 
 
243 aa  128  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.56 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.02 
 
 
235 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.1 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>