239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2830 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.78 
 
 
255 aa  248  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.04 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.04 
 
 
259 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.23 
 
 
268 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.41 
 
 
251 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.8 
 
 
265 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.54 
 
 
257 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.83 
 
 
262 aa  221  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.38 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.37 
 
 
252 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.53 
 
 
245 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
258 aa  214  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.93 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.13 
 
 
238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.26 
 
 
254 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.94 
 
 
271 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  45.23 
 
 
237 aa  209  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.11 
 
 
240 aa  208  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.93 
 
 
239 aa  208  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.72 
 
 
245 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.96 
 
 
246 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.63 
 
 
238 aa  205  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  47.3 
 
 
245 aa  204  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.55 
 
 
246 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.44 
 
 
248 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.8 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.06 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.52 
 
 
276 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.77 
 
 
250 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.5 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.77 
 
 
247 aa  195  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.51 
 
 
250 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.13 
 
 
255 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.53 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.53 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.57 
 
 
255 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.15 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 
251 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 
240 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.52 
 
 
243 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.52 
 
 
243 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.52 
 
 
243 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.52 
 
 
243 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
258 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.52 
 
 
243 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
258 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1137  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
258 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.65 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2167  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761233  normal  0.284873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 
248 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4249  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.8 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.5 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1013  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1600  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.18 
 
 
239 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
257 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
257 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
257 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
257 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
257 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
257 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 
254 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 
235 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.2 
 
 
240 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.2 
 
 
240 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.05 
 
 
241 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.05 
 
 
241 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  35.22 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.22 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.22 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.22 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.22 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  35.22 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.22 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1885  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.62 
 
 
239 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000732794  hitchhiker  0.00000000475833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.75 
 
 
239 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.78 
 
 
243 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.06 
 
 
254 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.2 
 
 
257 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.78 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.8 
 
 
241 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1002  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.04 
 
 
239 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 
243 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.17 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  33.33 
 
 
250 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.78 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2729  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
239 aa  131  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.33 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.77 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.86 
 
 
264 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.91 
 
 
265 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.35 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>