239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0630 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  67.67 
 
 
245 aa  331  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  62.71 
 
 
238 aa  320  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  61.51 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  63.29 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.17 
 
 
237 aa  299  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.81 
 
 
238 aa  298  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  59.75 
 
 
237 aa  295  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.15 
 
 
245 aa  279  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.3 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.38 
 
 
259 aa  223  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.01 
 
 
255 aa  222  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.96 
 
 
259 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.59 
 
 
260 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.59 
 
 
260 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.38 
 
 
247 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.55 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.05 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.38 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.52 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.13 
 
 
252 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.3 
 
 
265 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.63 
 
 
241 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.3 
 
 
271 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.58 
 
 
251 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.11 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.36 
 
 
255 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.52 
 
 
245 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.33 
 
 
246 aa  191  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.23 
 
 
276 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.91 
 
 
246 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.81 
 
 
250 aa  187  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.41 
 
 
254 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.33 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.56 
 
 
244 aa  178  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.92 
 
 
250 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.66 
 
 
235 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.82 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.82 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
236 aa  161  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.96 
 
 
236 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.99 
 
 
235 aa  158  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.03 
 
 
240 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
264 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
243 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1690  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.86 
 
 
236 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.368912  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 
248 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.09 
 
 
248 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
248 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.7 
 
 
270 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
243 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
248 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  38.53 
 
 
243 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  38.53 
 
 
243 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.53 
 
 
243 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0184  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.3 
 
 
248 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.53 
 
 
243 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.53 
 
 
243 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  38.53 
 
 
243 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.53 
 
 
243 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0064  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.91 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.757519  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.66 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
243 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.53 
 
 
240 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.66 
 
 
246 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
246 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0805  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.916602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.13 
 
 
245 aa  151  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
238 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
246 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
246 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.96 
 
 
248 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.19 
 
 
238 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
246 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 
255 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
248 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2609  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.24 
 
 
254 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0258596  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.1 
 
 
245 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.79 
 
 
264 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.77 
 
 
245 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.17 
 
 
249 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2729  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.87 
 
 
239 aa  148  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.53 
 
 
260 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.48 
 
 
240 aa  148  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.48 
 
 
240 aa  148  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.96 
 
 
250 aa  148  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.45 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.96 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.62 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.96 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0646  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
240 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.44 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>