239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2616 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
259 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  98.84 
 
 
259 aa  526  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  82.49 
 
 
257 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  79.53 
 
 
258 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  77.24 
 
 
268 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  79.92 
 
 
262 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.97 
 
 
252 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.87 
 
 
265 aa  353  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.62 
 
 
254 aa  344  8.999999999999999e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70 
 
 
276 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.2 
 
 
271 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.82 
 
 
255 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.54 
 
 
247 aa  254  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.56 
 
 
255 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.04 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.05 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.28 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.28 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  48.75 
 
 
245 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.38 
 
 
238 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.74 
 
 
248 aa  221  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.22 
 
 
237 aa  221  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.93 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.64 
 
 
238 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.95 
 
 
239 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.8 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.31 
 
 
250 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.13 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.84 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.15 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.38 
 
 
246 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  43.98 
 
 
237 aa  208  8e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.85 
 
 
250 aa  207  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.55 
 
 
245 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.96 
 
 
246 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.81 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.71 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.98 
 
 
255 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.69 
 
 
264 aa  155  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 
264 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.2 
 
 
248 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
244 aa  153  2e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.67 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.8 
 
 
240 aa  148  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.8 
 
 
240 aa  148  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.9 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.75 
 
 
249 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.97 
 
 
248 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.6 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.18 
 
 
247 aa  145  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.25 
 
 
247 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
238 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.93 
 
 
235 aa  142  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.24 
 
 
248 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
251 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
240 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.92 
 
 
238 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  39.51 
 
 
245 aa  141  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.74 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.66 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.18 
 
 
246 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.43 
 
 
243 aa  139  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.75 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1017  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.76 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.47 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.73 
 
 
243 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.8 
 
 
243 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
243 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2167  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.5 
 
 
258 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761233  normal  0.284873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.59 
 
 
243 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1013  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.34 
 
 
258 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  34.87 
 
 
243 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.87 
 
 
243 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.29 
 
 
246 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.64 
 
 
248 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4249  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.5 
 
 
258 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  34.87 
 
 
243 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.07 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.92 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
243 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.75 
 
 
243 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.86 
 
 
246 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
243 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.5 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1137  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.5 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 
254 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.97 
 
 
254 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.13 
 
 
240 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.75 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>