239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0014 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.98 
 
 
255 aa  363  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.58 
 
 
260 aa  348  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  73.17 
 
 
260 aa  346  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  58.54 
 
 
259 aa  254  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.2 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  56.38 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.07 
 
 
251 aa  238  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.1 
 
 
252 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.82 
 
 
265 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.06 
 
 
268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  53.04 
 
 
245 aa  232  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.28 
 
 
255 aa  232  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.1 
 
 
262 aa  229  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.91 
 
 
258 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.8 
 
 
240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.69 
 
 
276 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.77 
 
 
238 aa  221  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.25 
 
 
271 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.38 
 
 
238 aa  216  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.39 
 
 
245 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.69 
 
 
254 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  47.37 
 
 
237 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.59 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.56 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.13 
 
 
238 aa  207  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.77 
 
 
241 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.53 
 
 
250 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.75 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.78 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.53 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.18 
 
 
246 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.77 
 
 
246 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.93 
 
 
255 aa  178  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.56 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.13 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.44 
 
 
244 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.35 
 
 
243 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.35 
 
 
243 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.77 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.77 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.77 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.77 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  40.93 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  40.93 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.93 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.93 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.93 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.93 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.93 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  40.93 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38 
 
 
244 aa  150  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.52 
 
 
243 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.51 
 
 
243 aa  148  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.14 
 
 
243 aa  146  3e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.7 
 
 
243 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.93 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2563  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117328  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.86 
 
 
241 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.11 
 
 
248 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.4 
 
 
236 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.7 
 
 
245 aa  142  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  40.91 
 
 
245 aa  141  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.02 
 
 
235 aa  141  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.02 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.29 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.69 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.13 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  39.06 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.89 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.3 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0196  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.35 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.9 
 
 
246 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.37 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.66 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.78 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.58 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.96 
 
 
245 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.07 
 
 
248 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1672  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.86 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0305  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.86 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.92 
 
 
270 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.11 
 
 
243 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.11 
 
 
243 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.19 
 
 
255 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.93 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.93 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.93 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.93 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.93 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.7 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.07 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.7 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2309  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.87 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0100361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.93 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0516  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 
248 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 
245 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.71 
 
 
248 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3873  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.62 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.532548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>