239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3259 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.41 
 
 
255 aa  225  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.17 
 
 
255 aa  221  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.14 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.71 
 
 
259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.01 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.48 
 
 
262 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.36 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.08 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.14 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.41 
 
 
252 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.83 
 
 
271 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.79 
 
 
260 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.17 
 
 
265 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.79 
 
 
260 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.93 
 
 
247 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.09 
 
 
239 aa  202  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
276 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
268 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.95 
 
 
258 aa  197  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  42.86 
 
 
237 aa  196  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.15 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.57 
 
 
241 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  44.44 
 
 
245 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.18 
 
 
237 aa  191  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.98 
 
 
238 aa  190  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.37 
 
 
254 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.73 
 
 
245 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.75 
 
 
244 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.27 
 
 
248 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.8 
 
 
250 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.91 
 
 
250 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.09 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.72 
 
 
246 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.31 
 
 
246 aa  164  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.51 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.63 
 
 
250 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.96 
 
 
250 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.32 
 
 
240 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.32 
 
 
251 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  40.87 
 
 
243 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  40.87 
 
 
243 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
243 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.03 
 
 
235 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.16 
 
 
257 aa  148  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
243 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
243 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
243 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.3 
 
 
243 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  40.87 
 
 
243 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.43 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.3 
 
 
265 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.03 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.31 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.31 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.31 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.31 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.71 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.31 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.31 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.93 
 
 
243 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.31 
 
 
257 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.92 
 
 
240 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1690  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.82 
 
 
236 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.368912  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.42 
 
 
255 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.36 
 
 
248 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.38 
 
 
243 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2729  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 
239 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1002  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.08 
 
 
239 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.36 
 
 
248 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.93 
 
 
245 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.4 
 
 
235 aa  141  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1804  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.82 
 
 
239 aa  141  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.207619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1600  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.24 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.3 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1885  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.86 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000732794  hitchhiker  0.00000000475833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2032  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.92 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.240988  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.7 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.67 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.2 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.24 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.2 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.34 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.93 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.95 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2257  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.93 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.91 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.17 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 
243 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.93 
 
 
248 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  38.36 
 
 
246 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.44 
 
 
240 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 
244 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.24 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.02 
 
 
264 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>