239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1713 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.63 
 
 
255 aa  253  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.05 
 
 
259 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.05 
 
 
259 aa  241  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.04 
 
 
252 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.85 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.66 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.07 
 
 
247 aa  238  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.61 
 
 
257 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.61 
 
 
258 aa  234  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.21 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.41 
 
 
241 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.06 
 
 
271 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.85 
 
 
262 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.02 
 
 
248 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.61 
 
 
250 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.83 
 
 
250 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.2 
 
 
260 aa  214  8e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.8 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.83 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.88 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.23 
 
 
254 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.84 
 
 
276 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.58 
 
 
238 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.4 
 
 
246 aa  198  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.6 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  47.15 
 
 
245 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.75 
 
 
239 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.84 
 
 
244 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.15 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.75 
 
 
238 aa  188  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.12 
 
 
245 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.27 
 
 
237 aa  185  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  44.72 
 
 
237 aa  185  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.15 
 
 
255 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.98 
 
 
238 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.65 
 
 
244 aa  159  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
235 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.37 
 
 
270 aa  148  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.82 
 
 
240 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.82 
 
 
251 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1573  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.313613  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 
240 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.63 
 
 
243 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.63 
 
 
243 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  36.21 
 
 
243 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.21 
 
 
243 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  36.21 
 
 
243 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.08 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.07 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.8 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0546  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.795821  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.73 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2892  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2818  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2837  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1786  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2463  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.48 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.6 
 
 
243 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1088  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 
254 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2776  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36 
 
 
257 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.73 
 
 
248 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.82 
 
 
248 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1600  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.66 
 
 
239 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1095  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.48 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.85 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1885  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
239 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000732794  hitchhiker  0.00000000475833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.12 
 
 
247 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2896  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 
254 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849823  normal  0.107907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.24 
 
 
239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.08 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1137  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.08 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2729  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.98 
 
 
239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.44 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.41 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.93 
 
 
243 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.03 
 
 
244 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4249  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.68 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.8 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.82 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.98 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2032  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.77 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.240988  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.29 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.4 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.68 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0805  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.78 
 
 
239 aa  133  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.916602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>