239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0252 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  54.04 
 
 
243 aa  252  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  54.04 
 
 
243 aa  252  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.04 
 
 
243 aa  252  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.04 
 
 
243 aa  252  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.04 
 
 
243 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  54.04 
 
 
243 aa  252  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.04 
 
 
243 aa  252  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.04 
 
 
243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.62 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.47 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.19 
 
 
243 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.16 
 
 
243 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.97 
 
 
243 aa  245  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4053  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.24 
 
 
235 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.539524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4015  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.24 
 
 
235 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.87 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.36 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.74 
 
 
243 aa  242  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.74 
 
 
243 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.32 
 
 
243 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.32 
 
 
243 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  50.85 
 
 
243 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  51.9 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
243 aa  238  8e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2333  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.32 
 
 
242 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.7 
 
 
270 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03533  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 
243 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  55.27 
 
 
243 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1500  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.9 
 
 
242 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.44 
 
 
248 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2526  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.08 
 
 
239 aa  235  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2455  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.68 
 
 
242 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2367  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.68 
 
 
242 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.01 
 
 
236 aa  235  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  50.42 
 
 
250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2309  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.87 
 
 
250 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0100361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.25 
 
 
243 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2032  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.64 
 
 
251 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.240988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4547  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.36 
 
 
240 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2166  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.67 
 
 
238 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1690  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.32 
 
 
236 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.368912  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.17 
 
 
251 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.17 
 
 
240 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0883  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.25 
 
 
245 aa  228  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.346326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.97 
 
 
247 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.06 
 
 
241 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.06 
 
 
241 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.73 
 
 
244 aa  226  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0795  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
246 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.69 
 
 
240 aa  225  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.69 
 
 
240 aa  225  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2522  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.63 
 
 
243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.63 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.89 
 
 
248 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2763  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.64 
 
 
245 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.105389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.64 
 
 
245 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1657  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.37 
 
 
249 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.59 
 
 
236 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.81 
 
 
238 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.74 
 
 
235 aa  222  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4119  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.31 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.019832  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12141  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.78 
 
 
323 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.224342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
245 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.16 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.05 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  52.97 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.81 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11981  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.66 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.526754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0737  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.36 
 
 
248 aa  218  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548789  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10801  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.86 
 
 
243 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.521124  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2729  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.21 
 
 
239 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1057  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
245 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1246  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.73 
 
 
245 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000778837  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.48 
 
 
246 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.15 
 
 
248 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.48 
 
 
240 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
248 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2926  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
265 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.63 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.75 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.661895  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3109  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.75 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00124308  normal  0.0210238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1350  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.81 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0751637  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1248  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.75 
 
 
245 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0135283  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1204  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.75 
 
 
245 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0207409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03404  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.75 
 
 
250 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.63 
 
 
246 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1162  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.75 
 
 
245 aa  215  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331804  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09561  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
245 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.361641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  49.79 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1002  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.68 
 
 
239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
246 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.94 
 
 
247 aa  214  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1885  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.79 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000732794  hitchhiker  0.00000000475833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>