More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0532 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  100 
 
 		 394 aa  749    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  56.35 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  49.3 
 
 		 402 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  46.37 
 
 		 378 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  45.74 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  43.78 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  43.13 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  44.03 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  42.19 
 
 		 408 aa  229  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  42.34 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  43.21 
 
 		 376 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  41.51 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  41.42 
 
 		 437 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  44.38 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  41.39 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  43.04 
 
 		 394 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  42.12 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  43.75 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  43.18 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  39.07 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  39.07 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  39.07 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  42.16 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  40.21 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  44.09 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  41.99 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  42.28 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  40.81 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  42.06 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  40.61 
 
 		 371 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  42.43 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  43.62 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  36.8 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  42.08 
 
 		 415 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  41.69 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  37.57 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  31.97 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  35.77 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  30.25 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  35.92 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  36.05 
 
 		 851 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  39.2 
 
 		 412 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.78 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.98 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.87 
 
 		 373 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  35.12 
 
 		 459 aa  175  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  34.86 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  34.32 
 
 		 371 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  32.35 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  37.53 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  30.14 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  37.78 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  32.11 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  33.51 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  29.97 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  33.77 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  32.28 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  30.3 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  37.07 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  29.7 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  39.34 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  29.22 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  38.96 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  29.7 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  34.71 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  38.69 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.9 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  33.7 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  28.91 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  39.69 
 
 		 441 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  29.43 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  29.43 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  34.79 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  38.23 
 
 		 811 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  33.15 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  35.36 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  29.44 
 
 		 408 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  33.42 
 
 		 441 aa  162  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  29.43 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  33.85 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  29.43 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  38.08 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  29.19 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  30.05 
 
 		 395 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  32.42 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  33.24 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  28.88 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  28.88 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  29.22 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  32.05 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  37.87 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  29.79 
 
 		 386 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  33.42 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  32.24 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  29.54 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  32.88 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  32.88 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  33.33 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  34.94 
 
 		 450 aa  152  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  40.33 
 
 		 849 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>