More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3485 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  100 
 
 		 380 aa  733    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  56.35 
 
 		 394 aa  342  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  54.34 
 
 		 402 aa  335  9e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  46.92 
 
 		 417 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  47.54 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  47.59 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  50 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  46.28 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  46.28 
 
 		 384 aa  265  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  46.94 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  47.51 
 
 		 376 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  44.17 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  47.63 
 
 		 374 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  47.92 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  44.69 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  48.19 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  43.25 
 
 		 408 aa  253  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  44.13 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  44.08 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  46.67 
 
 		 394 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  44.48 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  43.8 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  40.87 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  40.87 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  40.87 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  46.05 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  45.48 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  44.38 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  44.66 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  41.53 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  44.83 
 
 		 415 aa  226  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  44.09 
 
 		 391 aa  226  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  45.36 
 
 		 410 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  42.63 
 
 		 412 aa  215  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  45.36 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  37.89 
 
 		 410 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  43.65 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  36.26 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.79 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  40.22 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  42.07 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  37.43 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  37.77 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.58 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.41 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  37.7 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  31.52 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  33.33 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  39.73 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  31.42 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  39.36 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  30.98 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  37.01 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  31.93 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  30.71 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  30.71 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  30.98 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  32.09 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  32.24 
 
 		 391 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  37.47 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  30.14 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.06 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  30.71 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.96 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  35.2 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  34.58 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  31.42 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  30.96 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.53 
 
 		 395 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  35.19 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  36.54 
 
 		 406 aa  186  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  31.23 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.19 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  36.56 
 
 		 851 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  31.1 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  31.98 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  40.22 
 
 		 811 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  31.17 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  40.74 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  34.25 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  38.75 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  35.32 
 
 		 433 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  33.33 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  38.89 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  35.61 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  39.3 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  39.02 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  32.6 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  32.79 
 
 		 402 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.69 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  32.36 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  37.06 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  38.77 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.33 
 
 		 834 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  39.02 
 
 		 395 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  33.24 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.43 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  34.43 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  31.65 
 
 		 386 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  30.89 
 
 		 379 aa  166  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>