More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0906 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  100 
 
 		 450 aa  917    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  68.64 
 
 		 459 aa  593  1e-168  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  49.64 
 
 		 441 aa  329  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  49.26 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  46.65 
 
 		 410 aa  326  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  47.1 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  46.93 
 
 		 378 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  42.93 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  42.61 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  43.1 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  43.24 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  43.81 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  43.07 
 
 		 381 aa  266  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  42.35 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  43.46 
 
 		 376 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  40.44 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  41.42 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  43.52 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  44.61 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  38.54 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  40.24 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  40.79 
 
 		 371 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  42.64 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  37.68 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  37.68 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  37.68 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  42.48 
 
 		 415 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  40.97 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  39.95 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  39.46 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  40.15 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  37.28 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  38.63 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  38.62 
 
 		 388 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  39.19 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.76 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.33 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  39.15 
 
 		 380 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  34.08 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  40.29 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  34.81 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.02 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  37.38 
 
 		 390 aa  204  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  34.48 
 
 		 373 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  34.64 
 
 		 373 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  34.35 
 
 		 391 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  40.2 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  39.11 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.66 
 
 		 390 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.14 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  37.99 
 
 		 401 aa  196  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  37.1 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  34.18 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.85 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  32.37 
 
 		 386 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.98 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  32.13 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  37.23 
 
 		 371 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  37.8 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  35.08 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  33.25 
 
 		 380 aa  183  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  33.74 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  32.5 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  34.88 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  35.06 
 
 		 376 aa  176  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  35.61 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  31.3 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.66 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  36.71 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  31.08 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  32.26 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  35.31 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  34.22 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  34.35 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  32.28 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  34.79 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.09 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  34.11 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  32.75 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.82 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  31.09 
 
 		 395 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  32.28 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  29.8 
 
 		 399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  30.29 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  33.18 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  33.88 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  34.94 
 
 		 394 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  30.77 
 
 		 376 aa  163  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  32.74 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  34.63 
 
 		 380 aa  162  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  31.3 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  30.71 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  32.21 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  29.3 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  31.09 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  33.5 
 
 		 375 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  31.3 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  30.83 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  31.96 
 
 		 851 aa  160  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  34.47 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>