More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0900 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  100 
 
 		 378 aa  745    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  56.03 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  53.39 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  52.85 
 
 		 372 aa  359  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  55.85 
 
 		 375 aa  358  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  52.12 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  54.86 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  55.14 
 
 		 376 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  53.37 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  54.47 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  52.97 
 
 		 371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  49.07 
 
 		 410 aa  334  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  54.03 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  54.08 
 
 		 374 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  53.53 
 
 		 378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  52.11 
 
 		 415 aa  325  7e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  48.15 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  49.87 
 
 		 417 aa  318  9e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  52.12 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  50.52 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  48.91 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  49.46 
 
 		 378 aa  309  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  52.46 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  49.46 
 
 		 437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  50.91 
 
 		 391 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  47.03 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  47.03 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  48.66 
 
 		 402 aa  302  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  47.03 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  47.11 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  47.07 
 
 		 390 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  45.95 
 
 		 366 aa  285  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  46.73 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  46.79 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  45.84 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  42.16 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  48.7 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  45.08 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  44.48 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  34.96 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  40.21 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  39.95 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  39.36 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  38.21 
 
 		 373 aa  216  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  37.3 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  35.33 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  30.52 
 
 		 373 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  36 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  36 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  32.07 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  42.04 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  38.11 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  31.52 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  37.6 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  37.24 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  35.31 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  38.07 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  36.8 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  36.68 
 
 		 851 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  32.18 
 
 		 380 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.33 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.51 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.51 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  32.97 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  33.16 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  32.71 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  32.43 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  32.8 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.97 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.39 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  33.16 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  32.71 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  36.6 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  32.53 
 
 		 391 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  36.19 
 
 		 358 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  32.43 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.34 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.47 
 
 		 395 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  37.74 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  38.5 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  30.34 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  36.46 
 
 		 375 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.42 
 
 		 388 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  35.69 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.24 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  32.61 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  31.98 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  29.7 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  37.6 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  35.5 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.22 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  36.56 
 
 		 358 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  36.41 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  36.12 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  31.81 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  33.42 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  35.85 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  35.31 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  35.47 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  35.85 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>