112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2009 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2009  antirestriction protein-like protein  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5347  antirestriction protein-like protein  57.38 
 
 		 134 aa  137  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.642698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  73.63 
 
 		 317 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  77.38 
 
 		 311 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  71.88 
 
 		 319 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  70.59 
 
 		 318 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  69.47 
 
 		 317 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  76.47 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  73.03 
 
 		 321 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  74.12 
 
 		 313 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  73.26 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  73.26 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  76.54 
 
 		 315 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  82.76 
 
 		 316 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  63.54 
 
 		 318 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  63.92 
 
 		 320 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3504  antirestriction protein-like protein  51.2 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519078  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  81.18 
 
 		 316 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  74.07 
 
 		 326 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  68.6 
 
 		 322 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  74.7 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  62.35 
 
 		 338 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  53.68 
 
 		 312 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  55.43 
 
 		 312 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  55.91 
 
 		 299 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  52 
 
 		 344 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0795  putative ArdC antirestriction protein  82.14 
 
 		 73 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.513635 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  57.32 
 
 		 328 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  40.3 
 
 		 184 aa  93.6  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  55.56 
 
 		 327 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  58.02 
 
 		 299 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  54.65 
 
 		 336 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  55.29 
 
 		 288 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  47.42 
 
 		 320 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2231  hypothetical protein  73.53 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  50.57 
 
 		 362 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  47.75 
 
 		 304 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  55.41 
 
 		 319 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  54.88 
 
 		 285 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  47.78 
 
 		 308 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  47.31 
 
 		 306 aa  84.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  42.37 
 
 		 306 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  47.31 
 
 		 306 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  50 
 
 		 322 aa  84  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  50 
 
 		 311 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  56.82 
 
 		 299 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  42.86 
 
 		 306 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3033  hypothetical protein  72.73 
 
 		 72 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  59.52 
 
 		 301 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  47.13 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  52.44 
 
 		 314 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  44.71 
 
 		 333 aa  80.5  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  52.69 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  52.94 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  48.81 
 
 		 325 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  46.59 
 
 		 297 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  47.06 
 
 		 1448 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1448 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2404  antirestriction protein  47.73 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.236455  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1077 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  44.32 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  53.93 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  46.99 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  45.88 
 
 		 1580 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  52.44 
 
 		 384 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  45.88 
 
 		 1495 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  42.11 
 
 		 300 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  43.53 
 
 		 410 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  48.94 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  47.19 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  49.43 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  45.05 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  40.5 
 
 		 308 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  39.39 
 
 		 297 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  46.88 
 
 		 308 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  48.31 
 
 		 332 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  48.31 
 
 		 434 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  48.31 
 
 		 332 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  46.15 
 
 		 308 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  48.39 
 
 		 284 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  47.19 
 
 		 332 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  48.24 
 
 		 311 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  50.6 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  42.57 
 
 		 308 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  36.75 
 
 		 308 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  43.33 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  44.44 
 
 		 326 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  44.44 
 
 		 326 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  37.76 
 
 		 310 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  39.29 
 
 		 986 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  38.37 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  37.08 
 
 		 296 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  38.82 
 
 		 313 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  33.08 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  37 
 
 		 682 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  41.11 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  39.22 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  41.18 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  39 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>