105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3504 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009469  Acry_3504  antirestriction protein-like protein  100 
 
 		 180 aa  364  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519078  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3263  antirestriction protein-like protein  91.67 
 
 		 107 aa  193  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703867  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  72.09 
 
 		 1448 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  72.09 
 
 		 1448 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  72.09 
 
 		 1580 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  72.09 
 
 		 410 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  70.93 
 
 		 986 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  65.31 
 
 		 1495 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2009  antirestriction protein-like protein  51.2 
 
 		 147 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  51.26 
 
 		 1077 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5347  antirestriction protein-like protein  43.51 
 
 		 134 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.642698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  38.24 
 
 		 384 aa  85.1  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  50.54 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  48.96 
 
 		 1457 aa  80.9  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  48.96 
 
 		 1449 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  48.84 
 
 		 316 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  45.83 
 
 		 1716 aa  77.8  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  47.19 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  48.28 
 
 		 362 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  46.39 
 
 		 317 aa  74.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  41.12 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  41.12 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  47.13 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  42 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  48.24 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  45.05 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  43.62 
 
 		 318 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  43.3 
 
 		 310 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  45.88 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  47.06 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  46.59 
 
 		 325 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  42.27 
 
 		 312 aa  70.9  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  44 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  45.78 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  45.78 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  46.51 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  46.08 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  44.19 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  39.8 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  42.86 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  45.78 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  43.02 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  43.37 
 
 		 328 aa  68.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  37.76 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  46.32 
 
 		 288 aa  68.2  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  42.86 
 
 		 312 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  46.74 
 
 		 304 aa  68.2  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  43.02 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  40.52 
 
 		 312 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  43.14 
 
 		 322 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  42.53 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  44.19 
 
 		 333 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  51.81 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  43.16 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  43.75 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  45.24 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  41.38 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  39.81 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  44.71 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2404  antirestriction protein  41.38 
 
 		 125 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.236455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  37.93 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  46.99 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  44.94 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  40.43 
 
 		 301 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  43.82 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  43.82 
 
 		 295 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  43.82 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  49.28 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  43.82 
 
 		 434 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  43.18 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  41.51 
 
 		 316 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.91 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  42.53 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  42.05 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  48.28 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  37.78 
 
 		 682 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  36.14 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  39.08 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  42.17 
 
 		 338 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  45.56 
 
 		 301 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  47.22 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  35.16 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  44.58 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  44.58 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  39.13 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  30.15 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  34.74 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  47.89 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  40.4 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  37.11 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  36.17 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  33.72 
 
 		 275 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  36.73 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  39.33 
 
 		 284 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  36.73 
 
 		 306 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  37.08 
 
 		 308 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  36.73 
 
 		 306 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  37.36 
 
 		 306 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1159  domain of unknown function DUF1738  34.74 
 
 		 389 aa  49.3  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  29.89 
 
 		 297 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>