45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3263 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3263  antirestriction protein-like protein  100 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703867  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3504  antirestriction protein-like protein  91.67 
 
 		 180 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  74 
 
 		 410 aa  87  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  72 
 
 		 1448 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  72 
 
 		 1448 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  72 
 
 		 1580 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  66.67 
 
 		 1495 aa  82.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  72 
 
 		 986 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  45.78 
 
 		 1077 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  43.4 
 
 		 325 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  43.75 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  34.58 
 
 		 1457 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  41.51 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2009  antirestriction protein-like protein  45 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  45.24 
 
 		 384 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  42 
 
 		 300 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  33.64 
 
 		 1716 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  38.75 
 
 		 1449 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  41.67 
 
 		 320 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  50 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  47.5 
 
 		 312 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  46 
 
 		 313 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  54.05 
 
 		 362 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2404  antirestriction protein  50 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.236455  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  44.26 
 
 		 310 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  48.72 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  42 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  42.22 
 
 		 318 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  45 
 
 		 317 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  52.38 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  60 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  37.29 
 
 		 321 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  42.86 
 
 		 317 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  42.22 
 
 		 306 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0795  putative ArdC antirestriction protein  37.5 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.513635 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  46.15 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  37.74 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  54.29 
 
 		 300 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  40.54 
 
 		 318 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  45.95 
 
 		 319 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  36.07 
 
 		 301 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  39.62 
 
 		 285 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  41.67 
 
 		 322 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>