74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0795 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0795  putative ArdC antirestriction protein  100 
 
 		 73 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.513635 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  83.56 
 
 		 318 aa  123  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  77.78 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  75.34 
 
 		 320 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  75.34 
 
 		 320 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  82.54 
 
 		 313 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  85.94 
 
 		 317 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  77.78 
 
 		 317 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  71.23 
 
 		 320 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  77.78 
 
 		 316 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  71.79 
 
 		 321 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  71.23 
 
 		 326 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  83.93 
 
 		 315 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  71.64 
 
 		 322 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2009  antirestriction protein-like protein  82.14 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3033  hypothetical protein  75.34 
 
 		 72 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  77.78 
 
 		 318 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  74.55 
 
 		 338 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  76.92 
 
 		 311 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  68.75 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2231  hypothetical protein  69.49 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  88.46 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  88 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  60.78 
 
 		 328 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  60 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  45.21 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  47.37 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  46.27 
 
 		 335 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  55.77 
 
 		 299 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  50 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  44.07 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  50.98 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  48.15 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  51.92 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  51.92 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  55.56 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  48.15 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  48.15 
 
 		 306 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  48.15 
 
 		 362 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  52.83 
 
 		 308 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  48.15 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  48.15 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  52 
 
 		 320 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  46.97 
 
 		 304 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  48.08 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  59.62 
 
 		 301 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  44.44 
 
 		 308 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  43.4 
 
 		 325 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  47.17 
 
 		 300 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2404  antirestriction protein  48.15 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.236455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  48.15 
 
 		 327 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  41.51 
 
 		 294 aa  48.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  36.76 
 
 		 297 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  48 
 
 		 384 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  42.19 
 
 		 280 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  42 
 
 		 333 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  51.85 
 
 		 300 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  44.23 
 
 		 297 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  46.43 
 
 		 308 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  37.74 
 
 		 297 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  55.77 
 
 		 299 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  40.74 
 
 		 311 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  53.85 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  42.59 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  50 
 
 		 300 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3263  antirestriction protein-like protein  37.5 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.703867  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3504  antirestriction protein-like protein  36 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.519078  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  36.67 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3933  hypothetical protein  41.3 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  41.54 
 
 		 308 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  49.02 
 
 		 321 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  50 
 
 		 285 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  50 
 
 		 314 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>