More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0205 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0205  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
228 aa  447  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  37.99 
 
 
209 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.2 
 
 
207 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  37.23 
 
 
212 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  37.1 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.89 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.57 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.65 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.14 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 
208 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33.14 
 
 
204 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.94 
 
 
207 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  33.14 
 
 
204 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
207 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  33.14 
 
 
194 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  33.14 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  33.14 
 
 
194 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  33.14 
 
 
194 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.56 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  33.14 
 
 
194 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 
207 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 
209 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.71 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.71 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  29.08 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  31.31 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.09 
 
 
216 aa  85.5  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.62 
 
 
209 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
204 aa  85.1  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 
211 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  35.25 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  29.35 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  29.35 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.35 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  29.35 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.89 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.72 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.09 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.1 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.39 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  31.1 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  31.1 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.15 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.3 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.86 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  32.07 
 
 
206 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.49 
 
 
204 aa  82  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  33.9 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  31.66 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.02 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  30.68 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35.81 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  36.36 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  34.04 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.79 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 
209 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  31.61 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.8 
 
 
218 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  29.29 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  30.46 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  27.08 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.73 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  28 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.66 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  29.76 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  31.68 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>