54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0037 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0037  dienelactone hydrolase  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  0.444574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1254  dienelactone hydrolase  59.92 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546126  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0693  dienelactone hydrolase  50 
 
 
260 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560412  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3206  dienelactone hydrolase  45.49 
 
 
285 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8749  putative dienelactone hydrolase  45.59 
 
 
260 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2009  dienelactone hydrolase family protein  43.77 
 
 
281 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2785  hypothetical protein  46.3 
 
 
263 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2068  dienelactone hydrolase  41.09 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4646  hypothetical protein  42.53 
 
 
265 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177547  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1154  dienelactone hydrolase family protein  46.53 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0699822  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4119  hypothetical protein  41.15 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0781409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4194  hypothetical protein  41.15 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668259  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4350  hypothetical protein  39.92 
 
 
277 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  38.05 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  35.4 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  37.17 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  37.84 
 
 
320 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  34.92 
 
 
305 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3190  twin-arginine translocation pathway signal  37.84 
 
 
320 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1000  dienelactone hydrolase  36.94 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0965  dienelactone hydrolase  36.94 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3378  dienelactone hydrolase  36.04 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  34.65 
 
 
299 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  35.77 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0985  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  31.01 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  27.74 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  31.71 
 
 
409 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  30.3 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  27.6 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  31.71 
 
 
409 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  30.88 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  29.66 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  30.4 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  29.85 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
303 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  31.45 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  30.4 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  30.4 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  26.26 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  30.88 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  30.4 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  25.97 
 
 
264 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  30.4 
 
 
295 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 
295 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  29.2 
 
 
227 aa  42  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  31.58 
 
 
298 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  26.42 
 
 
262 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  34.21 
 
 
307 aa  42  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>