36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1254 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1254  dienelactone hydrolase  100 
 
 
277 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546126  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0037  dienelactone hydrolase  59.92 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  0.444574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0693  dienelactone hydrolase  53.61 
 
 
260 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560412  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3206  dienelactone hydrolase  46.74 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8749  putative dienelactone hydrolase  49.05 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2785  hypothetical protein  47.77 
 
 
263 aa  205  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4646  hypothetical protein  43.89 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177547  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2009  dienelactone hydrolase family protein  44.61 
 
 
281 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2068  dienelactone hydrolase  43.89 
 
 
283 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4350  hypothetical protein  42.37 
 
 
277 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4119  hypothetical protein  42.37 
 
 
277 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0781409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4194  hypothetical protein  42.37 
 
 
277 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668259  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1154  dienelactone hydrolase family protein  40.33 
 
 
261 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0699822  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  34.15 
 
 
409 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  34.15 
 
 
409 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  35.09 
 
 
241 aa  55.8  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
415 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
415 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  30.91 
 
 
407 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  32.52 
 
 
415 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
415 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  29.81 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  28.83 
 
 
407 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  30.26 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  32.41 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  31.15 
 
 
413 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  28.99 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  33.93 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  30.33 
 
 
413 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  29.1 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  28.91 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.04 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.16 
 
 
236 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  29.2 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>