17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3206 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3206  dienelactone hydrolase  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0693  dienelactone hydrolase  51.32 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560412  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1254  dienelactone hydrolase  46.74 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546126  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4350  hypothetical protein  46.35 
 
 
277 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8749  putative dienelactone hydrolase  44.36 
 
 
260 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2785  hypothetical protein  49.61 
 
 
263 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4119  hypothetical protein  45.99 
 
 
277 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0781409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4194  hypothetical protein  45.99 
 
 
277 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668259  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4646  hypothetical protein  43.23 
 
 
265 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.177547  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0037  dienelactone hydrolase  45.49 
 
 
262 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889494  normal  0.444574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2068  dienelactone hydrolase  42.11 
 
 
283 aa  204  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2009  dienelactone hydrolase family protein  41.54 
 
 
281 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1154  dienelactone hydrolase family protein  44.65 
 
 
261 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0699822  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  30.83 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  21.01 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  27.63 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>