104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6266 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  100 
 
 
117 aa  241  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  65.52 
 
 
129 aa  152  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  53.17 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  49.6 
 
 
136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  47.83 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1743  hypothetical protein  51.75 
 
 
115 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  43.48 
 
 
116 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  44.64 
 
 
123 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  43.48 
 
 
119 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  45.45 
 
 
122 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  39.13 
 
 
117 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  37.61 
 
 
118 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  41.94 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  41.28 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  39.32 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  43.12 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  48.04 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  45.16 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  42.24 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  42.73 
 
 
163 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  43.2 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  38.26 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  38.74 
 
 
117 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  49.49 
 
 
137 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  37.84 
 
 
117 aa  85.9  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  37.84 
 
 
117 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  39.64 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  38.05 
 
 
126 aa  84  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  35.54 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  37.84 
 
 
117 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  35.17 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  37.84 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  37.84 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  34.48 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  34.51 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  43.96 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  34.56 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0473  hypothetical protein  37.37 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  37.78 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  37.78 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  37.78 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  37.78 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  37.78 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  37.78 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  37.78 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0597  hypothetical protein  37.78 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  37.39 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  45.56 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  36.52 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  34.48 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  36.46 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  36.52 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  36.46 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  36.52 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  36.46 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  39.42 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  36.46 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  37.07 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  37.07 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  38.53 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  38.53 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  38.53 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  35.64 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  34.65 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1085  hypothetical protein  32.17 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.521139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0269  30S ribosomal protein S8  34.74 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2779  protein of unknown function DUF419  30.17 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273215  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3016  hypothetical protein  42.11 
 
 
117 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0177122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  31.9 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0489  hypothetical protein  38.57 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131029  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0377  hypothetical protein  26.37 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  35.71 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2611  hypothetical protein  36.76 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2801  hypothetical protein  36.76 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.950543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2592  hypothetical protein  36.84 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.550505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  32.76 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2809  hypothetical protein  36.76 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000596954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  33.63 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  28.45 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  32.48 
 
 
121 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  29.57 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0449  hypothetical protein  27.45 
 
 
354 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000397187  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3350  protein of unknown function DUF419  50 
 
 
222 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  28.45 
 
 
119 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  29.31 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  34.78 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5080  hypothetical protein  31.9 
 
 
124 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  29.31 
 
 
118 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2807  hypothetical protein  39.53 
 
 
45 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>