81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0402 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  40.52 
 
 
117 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  43.48 
 
 
116 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  42.98 
 
 
120 aa  100  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3310  hypothetical protein  38.05 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.834963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2412  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04880  hypothetical protein  44.83 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1369  hypothetical protein  38.46 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12530  hypothetical protein  39.58 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6266  protein of unknown function DUF419  34.48 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1268  hypothetical protein  33.59 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457076 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1903  protein of unknown function DUF419  37.96 
 
 
118 aa  77  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0411989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0459  protein of unknown function DUF419  35.4 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0675  hypothetical protein  34.55 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0185336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0618  hypothetical protein  34.55 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0691  hypothetical protein  34.55 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0632  hypothetical protein  34.55 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12150  hypothetical protein  37.37 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.42032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  34.78 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2999  protein of unknown function DUF419  39.45 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000726893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0660  hypothetical protein  36.27 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  33 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0626  hypothetical protein  36.27 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00529  hypothetical protein  36.27 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00540  hypothetical protein  36.27 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3050  protein of unknown function DUF419  36.27 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0473  hypothetical protein  36.27 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0597  hypothetical protein  36.27 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3067  hypothetical protein  36.27 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62125  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1602  hypothetical protein  38.38 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0598  hypothetical protein  35.29 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1371  hypothetical protein  40.38 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.609964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  36.7 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1075  hypothetical protein  31.43 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3840  protein of unknown function DUF419  37.07 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589165  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  34.48 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  32.74 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1927  protein of unknown function DUF419  37.36 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0988837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0309  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3944  protein of unknown function DUF419  32.32 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1730  hypothetical protein  28.48 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1743  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0673  protein of unknown function DUF419  29.37 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2559  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0215173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12540  hypothetical protein  27.19 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0752  hypothetical protein  32.77 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.593023  normal  0.111189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3852  hypothetical protein  32.77 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3762  hypothetical protein  32.77 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000158587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2831  hypothetical protein  33.94 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00686416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2528  hypothetical protein  34.21 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0443587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4594  hypothetical protein  31.3 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2605  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.516172  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4595  hypothetical protein  31.3 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  35.64 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2851  hypothetical protein  33.94 
 
 
117 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00191961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4646  hypothetical protein  30.43 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.449412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2810  putative cytoplasmic protein  32.46 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2480  hypothetical protein  32.46 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.571582  normal  0.751222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0535  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375319  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4508  protein YjbR  30.43 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4500  protein YjbR  30.43 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3970  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4519  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3935  protein of unknown function DUF419  32 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4571  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4609  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03889  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.137407  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4299  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03929  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5560  hypothetical protein  32 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476259  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1085  hypothetical protein  29.75 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.521139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  30.19 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0260  hypothetical protein  28 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4443  hypothetical protein  31.3 
 
 
117 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0489  hypothetical protein  34.52 
 
 
106 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131029  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  26.27 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  30.95 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2917  hypothetical protein  28.42 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2484  hypothetical protein  27.43 
 
 
114 aa  42.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6087  protein of unknown function DUF419  33.77 
 
 
118 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.987598  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5080  hypothetical protein  29.46 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>