13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5080 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5080  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  248  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5090  DifB protein  50.43 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  28.57 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20250  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0498  hypothetical protein  29.13 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00553264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  34.21 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003643  hypothetical protein  31.78 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1364  protein of unknown function DUF419  27.27 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0285  protein of unknown function DUF419  31.82 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.538961  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1946  protein of unknown function DUF419  27.62 
 
 		 116 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  34.82 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0402  hypothetical protein  29.46 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00249304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  32.41 
 
 		 121 aa  40.8  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>