33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1077 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  100 
 
 		 121 aa  238  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  46.79 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  41.96 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  40.95 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  38.95 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  36.94 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  38.38 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  30.69 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  36.36 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  35.92 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  32.41 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  26.85 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  36.36 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  34.17 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  23.76 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  35.35 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5090  DifB protein  28.83 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  32.69 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3136  hypothetical protein  33.72 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  39.83 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  29.13 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  30.89 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0837  hypothetical protein  32 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0823  hypothetical protein  26 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  33.33 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  32.28 
 
 		 131 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1879  hypothetical protein  30.68 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4507  hypothetical protein  30.56 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5080  hypothetical protein  32.41 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2409  hypothetical protein  29.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  32.65 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>