19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7450 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  57.8 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1879  hypothetical protein  57.14 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3136  hypothetical protein  49.53 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  39.64 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  38.95 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  31.62 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  37 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  37.4 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  29.17 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  27.52 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12590  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  31.73 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  27 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  30.91 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  30.93 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  29.59 
 
 		 118 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>