26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0225 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  87.29 
 
 
118 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  84.75 
 
 
118 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  63.96 
 
 
113 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  48.18 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  45.79 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  44 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  49.54 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  40.19 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  38 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  40.43 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  28.87 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  37 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  38.38 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  34.26 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0948  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.61 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.57219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  33.68 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5156  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320276  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  32.04 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  33.63 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3136  hypothetical protein  29.66 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  37.27 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  28.57 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  31.37 
 
 
114 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>