22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0193 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  97.46 
 
 		 118 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  84.75 
 
 		 118 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  66.36 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  45.79 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  43 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  43.93 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  53 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  40.74 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  36.79 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  40.43 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  28.87 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  34 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5156  hypothetical protein  35.63 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  35.35 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  29.36 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  35.24 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  33.62 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  32.32 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  27.78 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  29.59 
 
 		 117 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>