22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4338 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  221  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  67.27 
 
 
118 aa  144  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  66.36 
 
 
118 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  63.96 
 
 
118 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  42.42 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  44.95 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  44.34 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  49.02 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  41.12 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  37 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  27.55 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  36.94 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  34.65 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  38.74 
 
 
114 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  35.45 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2021  hypothetical protein  37 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367854  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  30.69 
 
 
121 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  32.65 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5156  hypothetical protein  36.67 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320276  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  32.11 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1879  hypothetical protein  31.48 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  30.93 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>