20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1645 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  246  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  52.1 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  55 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  53 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  49.54 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  44.04 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  49.02 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  41.84 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  40.82 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  36.28 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5156  hypothetical protein  35.24 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320276  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  29.67 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  38.18 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2021  hypothetical protein  35.35 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367854  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  39.83 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  34.13 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4507  hypothetical protein  36.04 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>