20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3874 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  61.21 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  40.91 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  34.55 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  32.41 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  34.68 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  32.08 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  32.67 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  28.04 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2905  hypothetical protein  30.95 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0621154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  27.52 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  34.21 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  32.8 
 
 		 137 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  34.11 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12590  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4507  hypothetical protein  30.97 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  31.53 
 
 		 128 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>