18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2905 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2905  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0621154  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  67.18 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  54.2 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4249  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  52.67 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1880  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  51.54 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.734657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  51.54 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121718  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1926  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  51.54 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0236938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0948  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.37 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.57219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  39.68 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2409  hypothetical protein  32.31 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  31.34 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0837  hypothetical protein  35.09 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  30.95 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  30.53 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4587  hypothetical protein  24.39 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  29.31 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>