14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4587 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4587  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  253  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  59.81 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2409  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  39.78 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  30.28 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0837  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0948  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.27 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.57219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1880  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  31.53 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.734657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1926  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  31.53 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0236938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  31.53 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121718  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  60.61 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2905  hypothetical protein  24.39 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0621154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4249  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  27.03 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>