26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0031 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  261  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.1 
 
 		 315 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2409  hypothetical protein  41.74 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  37.4 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1880  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  35 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.734657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1926  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  35 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0236938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  35 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121718  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  34.92 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4587  hypothetical protein  39.78 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0948  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.88 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.57219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0837  hypothetical protein  33.64 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2905  hypothetical protein  31.34 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0621154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  30.36 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  30.33 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4249  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  32.2 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  30.91 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1684  hypothetical protein  35.14 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  29.51 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  29.91 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  32.46 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  33.62 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  27.59 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0788  protein of unknown function DUF661  29.51 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  26.36 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  31.53 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>