17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0948 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0948  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 		 142 aa  283  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.57219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4249  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  54.96 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  54.2 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  50.76 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1880  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  52.76 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.734657  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  52.76 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121718  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1926  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  52.76 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0236938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2905  hypothetical protein  47.37 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0621154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.84 
 
 		 315 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  37.7 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  33.88 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2409  hypothetical protein  34.21 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4587  hypothetical protein  37.27 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  33.61 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  29.17 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0837  hypothetical protein  35.19 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>