22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3510 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  244  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  44.76 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  34.26 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  36.79 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  37 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  36.79 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  38 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  33.66 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  35.45 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  38.71 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  34.83 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  30.69 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0948  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.17 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.800418  normal  0.57219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2905  hypothetical protein  29.31 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0621154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1811  hypothetical protein  25.69 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  27.27 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121718  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1926  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  27.27 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0236938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1880  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  27.27 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.734657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  28.43 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>