14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0485 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  48.6 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  41.84 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  34.41 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  38.78 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  34.83 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  37 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  35.14 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  36 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  32.65 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  34 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  32.65 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  33.68 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  32.65 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>