32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2827 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  47.32 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  46.79 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  44.95 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  40.19 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  39.64 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  39.81 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  31.63 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  37.62 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  35.9 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  35.24 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  34 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  36.28 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  29.91 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  28.7 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  32.65 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5156  hypothetical protein  34.02 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  30.09 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  35.11 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  35.42 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  29.1 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3136  hypothetical protein  39.29 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1879  hypothetical protein  37.18 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5080  hypothetical protein  34.82 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  32.26 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121718  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1926  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  32.26 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0236938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1880  phosphoribosylglycinamide formyltransferase protein  32.26 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.734657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1811  hypothetical protein  31.19 
 
 		 204 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0681892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>