13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3136 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3136  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  57.39 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1879  hypothetical protein  58.88 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  49.53 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  39.29 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  39.76 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  33.72 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  29.55 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  29.66 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12590  hypothetical protein  40.74 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  37.7 
 
 		 114 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  37.08 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  36.25 
 
 		 126 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>