40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6405 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  63.28 
 
 
134 aa  164  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12590  hypothetical protein  57.03 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301758  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  51.61 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  47.69 
 
 
114 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3170  protein of unknown function DUF661  41.54 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0381886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  43.65 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5608  hypothetical protein  42.22 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.705957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2967  protein of unknown function DUF661  38.52 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1086  hypothetical protein  41.53 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.662136  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5358  hypothetical protein  41.38 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5073  hypothetical protein  40.16 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4977  hypothetical protein  41.38 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.715965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5065  hypothetical protein  41.38 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2592  hypothetical protein  40.52 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  32.31 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  36.72 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  39.09 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  35.11 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  37.4 
 
 
117 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  32.58 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  26.4 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0788  protein of unknown function DUF661  29.6 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145072 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  29.17 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  29.17 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  29.17 
 
 
110 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  29.91 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  29.17 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1128  hypothetical protein  31.93 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  31.45 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2409  hypothetical protein  32 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0521  hypothetical protein  30.51 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2584  hypothetical protein  30.51 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0493  hypothetical protein  27.5 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2877  hypothetical protein  29.17 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.546815  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  32.28 
 
 
121 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4507  hypothetical protein  31.67 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  34.11 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3136  hypothetical protein  37.08 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  23.28 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>