26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6246 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  259  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1086  hypothetical protein  69.09 
 
 
117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.662136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  43.65 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  44.25 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12590  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301758  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  40.68 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  37.12 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  36.45 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5608  hypothetical protein  38.52 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.705957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2592  hypothetical protein  35.09 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5073  hypothetical protein  38.02 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5358  hypothetical protein  32.73 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3170  protein of unknown function DUF661  30.51 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0381886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4977  hypothetical protein  32.73 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.715965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5065  hypothetical protein  32.73 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  34.13 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  34.21 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  33.61 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  31.78 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  32.46 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  31.93 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  31.78 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  32.56 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  31.78 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  34.48 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2967  protein of unknown function DUF661  34.09 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>