26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1426 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  100 
 
 
137 aa  265  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  51.61 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12590  hypothetical protein  49.61 
 
 
129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301758  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  41.88 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  37.12 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3170  protein of unknown function DUF661  31.97 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0381886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1086  hypothetical protein  35.77 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.662136  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2967  protein of unknown function DUF661  35.56 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  32.46 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  29.57 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  31.58 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  32.46 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  38.1 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  29.82 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0493  hypothetical protein  29.82 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  31.88 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1879  hypothetical protein  32.06 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2877  hypothetical protein  29.82 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.546815  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0521  hypothetical protein  29.2 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2584  hypothetical protein  29.2 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5608  hypothetical protein  30.28 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.705957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  46.3 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  31.73 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  32.8 
 
 
120 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0959  hypothetical protein  46.51 
 
 
50 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>