32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0425 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  230  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  97.37 
 
 		 114 aa  224  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  92.11 
 
 		 114 aa  214  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0493  hypothetical protein  91.23 
 
 		 114 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2584  hypothetical protein  91.23 
 
 		 114 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0521  hypothetical protein  91.23 
 
 		 114 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2877  hypothetical protein  89.72 
 
 		 112 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.546815  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  87.04 
 
 		 110 aa  194  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  53.85 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0823  hypothetical protein  55.21 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3576  hypothetical protein  86.27 
 
 		 56 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.572726  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0960  hypothetical protein  84.31 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3602  hypothetical protein  84.31 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3592  hypothetical protein  84.31 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0664  hypothetical protein  84.31 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  43.69 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0959  hypothetical protein  77.08 
 
 		 50 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0663  hypothetical protein  73.91 
 
 		 47 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3601  hypothetical protein  73.91 
 
 		 47 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3575  hypothetical protein  73.91 
 
 		 55 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  37.38 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0788  protein of unknown function DUF661  36.54 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0883  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.68 
 
 		 315 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1684  hypothetical protein  33.02 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  31.58 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  29.17 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  33.85 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  31.78 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4507  hypothetical protein  52.08 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  31.37 
 
 		 118 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>