23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0823 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0823  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  60.42 
 
 
110 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  56.25 
 
 
114 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0493  hypothetical protein  56.25 
 
 
114 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  55.21 
 
 
114 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2877  hypothetical protein  53.92 
 
 
112 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.546815  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  51.92 
 
 
114 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2584  hypothetical protein  55.91 
 
 
114 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0521  hypothetical protein  55.91 
 
 
114 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  39 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3576  hypothetical protein  59.57 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.572726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3602  hypothetical protein  59.57 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3592  hypothetical protein  59.57 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653657  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0960  hypothetical protein  59.57 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0664  hypothetical protein  59.57 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1684  hypothetical protein  34.31 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.71676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  38.98 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  26 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  26.92 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  32.84 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3575  hypothetical protein  54.76 
 
 
55 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0959  hypothetical protein  51.16 
 
 
50 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>