29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0521 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2584  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0521  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0493  hypothetical protein  96.49 
 
 
114 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  90.35 
 
 
114 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  91.23 
 
 
114 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  88.6 
 
 
114 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  87.27 
 
 
110 aa  197  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2877  hypothetical protein  88.79 
 
 
112 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.546815  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  53.92 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0823  hypothetical protein  55.91 
 
 
104 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3576  hypothetical protein  82.35 
 
 
56 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.572726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0664  hypothetical protein  80.39 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0960  hypothetical protein  80.39 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3592  hypothetical protein  80.39 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3602  hypothetical protein  80.39 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0959  hypothetical protein  77.55 
 
 
50 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  41.58 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3601  hypothetical protein  74.47 
 
 
47 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3575  hypothetical protein  74.47 
 
 
55 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0663  hypothetical protein  74.47 
 
 
47 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  40 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0788  protein of unknown function DUF661  40.24 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0883  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1684  hypothetical protein  32.08 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.71676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.5 
 
 
315 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  34.18 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  29.31 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  29.2 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  30.51 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>