13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0883 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0883  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  240  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  47.83 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0425  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400376  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0788  protein of unknown function DUF661  46.38 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3608  hypothetical protein  36.46 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0493  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2584  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0521  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2877  hypothetical protein  35.42 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.546815  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2922  hypothetical protein  36.46 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  35.65 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>