15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1086 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1086  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  236  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.662136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  69.09 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  45.45 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  41.53 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  35.77 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12590  hypothetical protein  36.36 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301758  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5073  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5358  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4977  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.715965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5065  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5608  hypothetical protein  35.34 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.705957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2592  hypothetical protein  29.66 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  29.13 
 
 
113 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>