22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12590 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12590  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  259  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.301758  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  57.03 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  51.13 
 
 
134 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  49.61 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  38.89 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3170  protein of unknown function DUF661  35.94 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0381886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5608  hypothetical protein  38.24 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.705957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2967  protein of unknown function DUF661  45.95 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2592  hypothetical protein  46.67 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1086  hypothetical protein  36.36 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.662136  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5073  hypothetical protein  33.59 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1768  hypothetical protein  36.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5358  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4977  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.715965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  27.37 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5065  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0904  protein of unknown function DUF661  43.75 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0754419  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3136  hypothetical protein  40.74 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  31.58 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0451  hypothetical protein  34.38 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0171814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>